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Dentre outros, são deveres do SINAEP:

1. Enaltecer a importância e a dignidade do trabalho como fato do desenvolvimento social e do bem comum;

2. Promover o desenvolvimento da solidariedade social nas relações do trabalho;

3. Promover a conciliação nos dissídios individuais e coletivos do trabalho;

4. Prestar orientação, informação e assistência jurídica, mantendo serviços dessa área aos associados;

5. Promover a defesa da ciência e da tecnologia nacionais e o seu desenvolvimento aplicado à melhoria das condições de vida do povo brasileiro;

6. Zelar pelo cumprimento da legislação, acordos e convenções coletivas de trabalho, sentenças normativas e similares;

7. Contribuir para a manutenção da Federação e Sistema Confederativo de representação sindical;

8. Contribuir e interferir, dentro de suas possibilidades e sempre que as condições se façam necessárias, nos processos de formação e aperfeiçoamento dos Administradores;

9. Cancelar a filiação do associado cujo comportamento fira o Código de Ética Profissional, a legislação vigente e os deveres a ele atribuídos no Estatuto.